Наиболее часто при синдроме Черногубова-Элерса-Данлоса встречаются такие коморбидные состояния, как недостаточность клапанов сердца и патология ЖКТ.

В последнее время был описана также ассоциация с синдромом постуральной ортостатической тахикардии, представляющий собой повышение ЧСС на 30 сокращений в минуту или до 120 ударов в минуту в первые 10 минут после вставания на ноги при отсутствии ортостатической гипотонии.

К прочим симптомам синдрома ортостатической тахикардии относятся нарушения сна, повышенная утомляемость, головокружение, гипомобильность пищевода, гастро-эзофагальный рефлюкс, нарушения со стороны мочевыделительной системы.

Предполагается, что в основе этого синдрома лежит избыток продукции гистамина и катехоламинов.

Некоторые пациенты жалуются на наличие болевых ощущений, интенсивность которых весьма вариабельна. Обычно выраженность боли коррелирует с нестабильностью суставов, однако, не во всех случаях именно последняя является причиной. Боль может иметь неврологический характер.

Определенную проблему  у больных синдромом Черногубова-Элерса-Данлоса представляет активация тучных клеток.  Клинически проявляется повышенной утомляемостью, крапивницей, сердечно-сосудистой патологией и нарушениями со стороны желудочно-кишечного тракта.

Современное лечение заключается в применении антигистаминных препаратов, а также назначении блокаторов рецепторов к лейкотриенам. Также есть данные об эффективности моноклональных антител.

К спектру коморбидных состояний относится также синдром или мальформация Арнольда-Киари, представляющая собой опущение миндалин мозжечка ниже большого затылочного отверстия.

Наиболее этому подвержены лица женского пола, возраст начала проявлений моложе, чем у мужчин. Общим симптомом является головная боль. Отмечается атлантоаксиальная и краниоцервикальная нестабильность, что может приводить, помимо болевого синдром, также и к  изменениям двигательной, чувствительной и рефлекторной функций.

Из психологический проблем могут наблюдаться тревожное расстройство,  депрессия, панические атаки, в связи с этим больные должны находиться под наблюдением психиатра.