Вход в систему

База данных штаммов N. gonorrhoeae, циркулирующих на территории РФ

БАЗА ДАННЫХ ШТАММОВ N. GONORRHOEAE, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

Соломка В.С., Полевщикова С.А., Нурутдинова О.С., Кубанов А.А.

ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий», г. Москва

Цель: Разработка и ведение базы данных по результатам изучения фено- и генотипических свойств возбудителей ИППП (в частности, N. gonorrhoeae) в Российской Федерации.

Материалы и методы: База данных возбудителей ИППП в Российской Федерации была разработана ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий» для систематизации сведений о свойствах культур N. gonorrhoeae, накопленных в ходе выполнения мероприятий Федеральной целевой программы «Предупреждение и борьба с социально значимыми заболеваниями (2007-2011 гг.)» в 2007-2008 годах. Изучение свойств штаммов N. gonorrhoeae проводилось микробиологическими (видовая идентификация

N. gonorrhoeae и определение чувствительности штаммов гонококка к антимикробным препаратам (АМП) методом серийных разведений в агаре) и молекулярно-генетическими методами (ПЦР, прямое секвенирование фрагментов генома N. gonorrhoeae, мини-секвенирование с последующим масс-спектрометрическим анализом).

Результаты: База данных культур штаммов N. gonorrhoeae размещена в Интернете на самостоятельном веб-сайте www.gnmon.ru и общедоступна. В базу данных помещены на хранение результаты изучения фено- и генотипических свойств штаммов N. gonorrhoeae, выделенных от пациентов из различных субъектов Российской Федерации. Разработанная база данных является реляционной, то есть каждая запись в таблице содержит информацию, относящуюся только к одному конкретному объекту. Формат базы данных культур штаммов N. gonorrhoeae сопоставим с международной базой NG-MAST для возможности обмена получаемыми данными и прослеживания клонального родства и распространения микроорганизмов, вызывающих ИППП. Основным аспектом применения сведений, заключенных в базе данных, является доведение доступной информации до специалистов лечебно-профилактических учреждений дерматовенерологического профиля, при этом специалист получает информацию о чувствительности возбудителя ИППП к АМП на уровне федеральных округов и конкретных субъектов Российской Федерации. Пользователям веб-сайта доступна следующая информация: количество изолятов N. gonorrhoeae, полученных из субъектов Российской Федерации; процент чувствительных, умеренно резистентных и резистентных к АМП штаммов N. gonorrhoeae; частота распространения генетических детерминант устойчивости N. gonorrhoeae к антимикробным препаратам; распределение молекулярных типов N. gonorrhoeae, циркулирующих в Российской Федерации. Данные, размещенные на веб-сайте, исключают возможность персональной идентификации пациентов, от которых были получены образцы биологического материала.

Выводы: Ведение и регулярное пополнение информационных ресурсов мониторинга антибиотикорезистентности возбудителей ИППП позволяет проводить как научную, так и практическую работу по предупреждению распространения возбудителей ИППП в Российской Федерации, анализировать полученную информацию о преобладающих механизмах резистентности микроорганизмов к АМП на территории Российской Федерации и доводить ее до сведения врачей дерматовенерологических учреждений. Базы данных дают также возможность изучать клональное родство микроорганизмов, вызывающих ИППП, как на территории Российской Федерации, так и за ее пределами, а также прогнозировать их распространение и контролировать эпидемиологическую ситуацию по ИППП.