БАЗА ДАННЫХ ШТАММОВ N. GONORRHOEAE, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
Соломка В.С., Полевщикова С.А., Нурутдинова О.С., Кубанов А.А.
ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий», г. Москва
Цель: Разработка и ведение базы данных по результатам изучения фено- и генотипических свойств возбудителей ИППП (в частности, N. gonorrhoeae) в Российской Федерации.
Материалы и методы: База данных возбудителей ИППП в Российской Федерации была разработана ФГУ «ГНЦД Росмедтехнологий» для систематизации сведений о свойствах культур N. gonorrhoeae, накопленных в ходе выполнения мероприятий Федеральной целевой программы «Предупреждение и борьба с социально значимыми заболеваниями (2007-2011 гг.)» в 2007-2008 годах. Изучение свойств штаммов N. gonorrhoeae проводилось микробиологическими (видовая идентификация
N. gonorrhoeae и определение чувствительности штаммов гонококка к антимикробным препаратам (АМП) методом серийных разведений в агаре) и молекулярно-генетическими методами (ПЦР, прямое секвенирование фрагментов генома N. gonorrhoeae, мини-секвенирование с последующим масс-спектрометрическим анализом).
Результаты: База данных культур штаммов N. gonorrhoeae размещена в Интернете на самостоятельном веб-сайте www.gnmon.ru и общедоступна. В базу данных помещены на хранение результаты изучения фено- и генотипических свойств штаммов N. gonorrhoeae, выделенных от пациентов из различных субъектов Российской Федерации. Разработанная база данных является реляционной, то есть каждая запись в таблице содержит информацию, относящуюся только к одному конкретному объекту. Формат базы данных культур штаммов N. gonorrhoeae сопоставим с международной базой NG-MAST для возможности обмена получаемыми данными и прослеживания клонального родства и распространения микроорганизмов, вызывающих ИППП. Основным аспектом применения сведений, заключенных в базе данных, является доведение доступной информации до специалистов лечебно-профилактических учреждений дерматовенерологического профиля, при этом специалист получает информацию о чувствительности возбудителя ИППП к АМП на уровне федеральных округов и конкретных субъектов Российской Федерации. Пользователям веб-сайта доступна следующая информация: количество изолятов N. gonorrhoeae, полученных из субъектов Российской Федерации; процент чувствительных, умеренно резистентных и резистентных к АМП штаммов N. gonorrhoeae; частота распространения генетических детерминант устойчивости N. gonorrhoeae к антимикробным препаратам; распределение молекулярных типов N. gonorrhoeae, циркулирующих в Российской Федерации. Данные, размещенные на веб-сайте, исключают возможность персональной идентификации пациентов, от которых были получены образцы биологического материала.
Выводы: Ведение и регулярное пополнение информационных ресурсов мониторинга антибиотикорезистентности возбудителей ИППП позволяет проводить как научную, так и практическую работу по предупреждению распространения возбудителей ИППП в Российской Федерации, анализировать полученную информацию о преобладающих механизмах резистентности микроорганизмов к АМП на территории Российской Федерации и доводить ее до сведения врачей дерматовенерологических учреждений. Базы данных дают также возможность изучать клональное родство микроорганизмов, вызывающих ИППП, как на территории Российской Федерации, так и за ее пределами, а также прогнозировать их распространение и контролировать эпидемиологическую ситуацию по ИППП.