Сегодня для диагностики грибковых инфекций могут быть использованы прямая микроскопия соскоба с КОН, культуральный метод, гистологический метод с Шифф-окрашиванием, ИФА с окрашиванием белым калькофлюором, ферментный анализ и ПЦР. Однако эти методы диагностики онихомикоза часто занимают много времени и могут давать ложноположительные или ложноотрицательные результаты. К недостаткам культурального метода относят значительные временные затраты (3-4 недели, а для недерматофитов и более), низкую чувствительность 43-50%, что может быть обусловлено в том числе и возможной гибелью грибов при транспортировке. Турецкие авторы сообщают о случае онихомикоза, диагностированного с помощью конфокальной микроскопии и подтвержденного микроскопией с гидроксидом калия и культуральным методом. Конфокальная микроскопия была проведена в естественных условиях и in vitro. Использовалось мультилазерное отражение с длиной волны 786 нм. В естественных условиях метод позволил четко идентифицировать ветвления гиф чуть ниже поверхности ногтевой пластины. Чувствительность и специфичность конфокальной микроскопии в диагностике онихомикозов пока не известна. Для этого необходимы крупные клинические испытания. Авторы полагают, что конфокальная микроскопия может оказаться надежным, практичным и неинвазивным методом в диагностике онихомикозов в ближайшем будущем.