О результатах типирования штаммов Neisseria gonorrhoeae по por-гену

Абрамов О.И.

ФГУ ЦНИКВИ Росмедтехнологий, г. Москва

Цель: изучение вариабельности штаммов Neisseria gonorrhoeae, полученных из различных регионов РоссийскойФедерации, путем выявления генетического полиморфизма por-гена.

Материалы и методы: образцы 166 штаммов N. gonorrhoeae из 12 регионов Российской Федерации, которые были исследованы с применением модифицированной методики секвенирования по Senger et al.(1964). Результаты: в результате проведенного исследования было установлено, что основная часть циркулирующих в регионах штаммов возбудителя гонококковой инфекции характеризуется наличием PIB-аллели — 163 из 166 изученных штаммов (98,3%), и незначительная часть — PIA аллелью, 3 штамма (1,7%). При этом внутри каждого серотипа выделяются подгруппы, характеризующиеся точечными мутациями изучаемого por-гена. В ходе работы было установлено, что наиболее неоднородные штаммы гонококка были получены в Санкт-Петербурге и в Москве, что объясняется, по-видимому, высокой миграционной активностью населения этих регионов.

Нами было проведено аналитическое сопоставление выявленных генетических характеристик изучаемых штаммов с международной базой данных по N.gonorrhoeae THE NG-MAST databases (www.ng-mast.net). Структура вариабельных нуклеотидных оснований por-гена изученных штаммов N.gonorrhoeae на 90-99% соответствовала сведениям, представленным в указанной базе данных, кроме того, было выявлено от 1 до 10% уникальных изменений нуклеотидных последовательностей в структуре por-гена. По совокупности вариационных изменений в области por-гена штаммы N.gonorrhoeae сходны с аннотированными в THE NG-MAST databases в среднем на 94%.

Выводы: на основании проведенных работ по изучению свойств штаммов N. gonorrhoeae можно с уверенностью утверждать, что por-типирования является наиболее предпочтительным из имеющихся в настоящее время методов типирования микроорганизмов, поскольку является не только наиболее информативным, но и дает возможность получать достоверные результаты (100% воспроизводимость результатов исследования) для сопоставления их с данными, полученными в других лабораториях, и таким образом получать комплексную картину о циркуляции возбудителя гонококковой инфекции. Целесообразно в дополнение к типированию по por гену исследовать полиморфизм по tbp гену, что расширит возможности установления филогенетического профиля российских штаммов N. gonorrhoeae в сравнении с зарубежными для прослеживания динамики дрейфа генов.